Conclusion
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Conclusion
Le séquençage de plus en plus complet de génomes permet d’avoir une masse d’information de plus en plus importante sur les gènes et sur leur évolution dans le monde du vivant. De ce fait, l’étude des gènes permet de comparer de plus en plus finement les gènes homologues entre différentes espèces proches ou éloignées. Cette comparaison aide à la compréhension de la fonction des gènes et nécessite des outils informatiques de plus en plus puissants pour permettre de comparer les séquences mais aussi les structures et les fonctions de ces gènes. Après avoir relevé le défi du séquençage global, l’étude de la fonction de tous les gènes identifiés devient un enjeu important pour la biologie.
Nous avons montré que chez les procaryotes, il existe des outils qui permettent d’étudier de façon relativement exhaustive la fonction de la plupart des gènes d’une bactérie. Cela a été rendu possible car des progrès très importants ont été faits à la fois dans les méthodes informatiques (ordinateurs de plus en plus puissants et programmes de plus en plus performants), mais aussi dans les méthodes expérimentales (automatisation de plus en plus poussée).
Pour arriver à ces résultats, les méthodes informatiques prennent de plus en plus d’importance, mais ne remplace pas les méthodes expérimentales qui restent indispensables. En fait il n’existe pas de "compétition" entre les deux approches mais une complémentarité indispensable pour permettre d’étudier la fonction d’un nombre de plus en plus important de gènes.
Chez les eucaryotes, un travail similaire a déjà été fait, notamment chez des levures. Mais la complexité des gènes et des mécanismes cellulaires rendent l’étude beaucoup plus complexe. Chez les eucaryotes multicellulaires, comme les mammifères, les mécanismes sont encore plus complexes car il existe de très nombreux types cellulaires avec, pour chacun de ces types de cellules, des fonctions différentes qui sont liées à des expressions géniques différentes. Aussi, en plus de l’étude des molécules et de leurs interactions, il faut étudier la fonction des différents types de cellules et leurs interactions. Les méthodes utilisées restent les même mais à des échelles différentes. Par exemple la mutagénèse dirigée permet de faire des individus transgéniques très utiles pour étudier la fonction d’un gène au niveau d’un organisme.
La biologie reste donc avant tout une science expérimentale même si, comme dans d’autres sciences les outils informatiques y prennent de plus en plus de place.
Plan
Problématique
Annexe : le séquençage
- Introduction
- Présentation du séquençage
- Chimie des molécules du vivant et technologie de l'ADN
- Historique du séquençage
- Comment se fait le séquençage ?
- Intérêt et buts du séquençage
- Les acteurs de la recherche
- La guerre privé-public
- Bibliographie
Annexe : autre
